Державною фіскальною службою України у листі від 25.08.2015 р. № 31376/7/99-99-15-01-04-17 дано розяснення про те, штрафні санкції та пеня, передбачені Податковим Кодексом за порушення строків, встановлених для самостійної сплати податкових зобов’язань з податку на додану вартість, не застосовуються за умови наявності у такі строки коштів на рахунках платників у системі електронного адміністрування податку на додану вартість в сумах, достатніх для сплати узгоджених податкових зобов’язань з податку на додану вартість до бюджету або на спеціальні рахунки платників — сільськогосподарських підприємств, що обрали спеціальний режим відповідно до статті 209 цього Кодексу.

У випадку нарахування протягом перехідного періоду системи електронного адміністрування податку на додану вартість вказаних штрафних санкцій, такі штрафні санкції підлягають списанню контролюючим органом за місцем реєстрації платника ПДВ протягом 14 робочих днів.